CSS HappyLifeさんより、HTML5でサイトを新規で作る際の、
HTMLファイル、CSSファイル、JSファイル構成のテンプレート化を紹介しているエントリーのご紹介。

HTML5-CSSHappyLife.jpg
【HTML5】新規でサイトを作るのに使えそうなの一式。Ver 1 – CSS HappyLife

構成されている各ファイルの説明も細かくされていて、
全データも丸っとダウンロードすることも出来ます。
HTML5でソースを記述する際の基本構造の参考になります。
jQueryもはじめから入っているが嬉しいところ。

うちでも新規サイト構築の際のHTML(CSS & JS)ファイルのテンプレート群はありますが、
HTML5用はまだ未作成。

こちらを参考にして近々作成してみようかと考え中。。。

ご参考までに。。。